A filtragem, seja por filtros mecânicos ou biológicos, tem como função manter a água do aquário limpa, com nível reduzido de amônia, detritos e secreções. Mesmo assim, é recomendada a renovação parcial da água

periodicamente. Afinal, um dos segredos da aquariofilia é a manutenção da água com boa qualidade.
Você pode começar essa renovação por meio da utilização de sifão no fundo do aquário, que retira, além da água, a sujeira acumulada no fundo. O sifão do aquarista consiste em uma mangueira, que deve preferencialmente estar acoplada a uma pequena peneira. Isso impedirá que as pedras do fundo do aquário sejam removidas junto com a água.

Não é necessário trocar toda a água do aquário, pelo contrário, isso deve ser feito aos poucos. A freqüência pode ser alterada dependendo do tamanho do aquário e do número e espécies de peixes. Em aquários de trinta a cem litros, a troca de água pode ser feita uma vez por mês, correspondendo a 20% do volume total. Em beteiras (pequenos aquários especiais para Betas), esse intervalo pode ser diminuído para 15 dias.

Quanto maior o aquário, mais estabilidade tem o habitat. Nesses casos, a renovação de água pode ser feita em intervalos maiores. Em aquários com mais de cem litros, deve-se fazer a sifonagem num intervalo de três a seis meses. A troca de água deve ser feita a cada três meses, correspondendo a 20% do volume total.

Mas se o aquário é habitado por Carpas, Japoneses e outros peixes de rio, a limpeza precisa de mais atenção. Essas espécies sujam mais a água com excreções e muco. Por isso, em aquários de mais de cem litros, a troca de água deve corresponder de 20 a 30% do volume total de água, uma vez por mês. Em aquários menores, a troca de água pode ser a cada quinze dias, e a sifonagem, uma vez por mês.

Ao preparar uma nova quantidade de água para colocar em seu aquário, lembre-se que suas condições devem estar semelhantes às oferecidas para seus peixes no momento. Cloro, resíduos de metais e pH diferente podem ser muito prejudiciais a seus pets. Uma dica é deixar a torneira aberta um pouco antes de começar a coletar a água, eliminando os resíduos que tenham ficado acumulados nos canos. Acrescente à água "nova" produtos anti-cloro, e regule o pH, para deixá-lo o mais próximo possível ao da água do aquário. A temperatura também deve ser similar.